生物鐘又稱生理鐘。它是生物體內的一種無形的“時鐘”，實際上是生物體生命活動的內在節律性，是由生物體內的時間結構序所決定。通過研究生物鐘，如今已產生了時辰生物學、時辰藥理學和時辰治療學等新學科。

研究生物鐘，在醫學上有著重要的意義，并對生物學的基礎理論研究起著促進作用。

定義

能夠在生命體內控制時間、空間發生發展的質和量叫生物鐘。

地球上的所有動物都有一種叫“生物鐘”的生理機制，也就是從白天到夜晚的一個24小時循環節律，比如一個光-暗的周期，與地球自轉一次吻合。生物鐘是受大腦的下丘腦"視交叉上核"(簡稱SCN)控制的，和所有的哺乳動物一樣，人類大腦中SCN所在的那片區域也正處在口腔上腭上方，我們有晝夜節律的睡眠，清醒和飲食行為都歸因于生物鐘作用。

功能

生物鐘有四點功能：提示時間、提示事件、維持狀態和禁止功能。

提示時間

是指你在一定的時間必須做某事，到了這個時間，你就自動會想起這件事來，比如你想第二天早上6點起床，到時你會自動起來。現實生活中有大部分事物都是時間提示起作用的，比如幾點上班、某時會見某人、愛人生日的獻花、愚人節、趕某趟車等等。

提示事件

是指當你遇到某事時，生物鐘可以自動提示另外一個事件的出現。比如有人拜托你將一件東西給甲，當你遇到甲時，生物鐘這一功能就會自動起作用，使你馬上想到這個托付的東西來。用得最多的是看到某事時，在你的大腦里所依次產生的那些“憶塊”(回憶的一種)，比如看到熊貓，你就會想到：它是中國的國寶、它喜歡吃竹子、它是中國作為友好象征出使國外的使者等等憶塊。再比如當你看到一道難題時，你就會調動很多憶塊，在一些規則的組合下，去求解它，這一連串的事情必須啟動你過去很多年時間里所學到的知識，這些知識是不會平白無故地出現于你的大腦的，它們必須在生物鐘的該功能作用下才可依次出現于你的大腦里。

維持狀態

是指人們在作某一事時，能夠使人一直做下去的力量。比如上8個小

生物鐘

時的班，就是生物鐘這一功能的結果，又比如人的眼睛觀看某一事時，能夠聚精會神地看，也是它的結果，當注意力從視覺轉向聽覺時，也是生物鐘作用的結果，那是提示事件功能在起作用，但是，你要聽完一堂課，你就必須用生物鐘的該功能才能聽完，否則你就會瞌睡不已，甚至逃課。這種維持可以是連續的也可以是斷續的維持，比如你和你愛人的家庭的維系就是斷續的，因為你不能長期呆在家里無所事事，你必須去工作，去交結，去謀取。

禁止功能

是指機體某個功能或行為可以被生物鐘終止。比如說看到一個恐怖的事件(如地震)，你無論在做什么，都有可能產生逃跑，這種逃跑就是對前面所做事物的終止。再比如說你在專心專一上網，結果你老爸打來了，你對上網的終止就是生物鐘的功能在起作用。如果沒有這種作用，一個人就會出現永不停頓的做事，比如睡覺，如果沒有這種終止，這個人就會長期睡下去，成為植物人。植物人發生的原因可能與此功能的失控有關。

相對這四點功能，在人的大腦里有對應的四個中樞：時間中樞、空間中樞、功能中樞和終止中樞。